Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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