Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms