Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms