Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WRT9

Gm28490, Predicted gene 28490, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28490A0A087WRT9 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Gm28490A0A087WRT9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Gm28490A0A087WRT9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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Gm28490A0A087WRT9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Gm28490A0A087WRT9 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Gm28490A0A087WRT9 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Gm28490A0A087WRT9 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Gm28490A0A087WRT9 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Gm28490A0A087WRT9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Gm28490A0A087WRT9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Gm28490A0A087WRT9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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