Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms