Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z331

Krt6b, Keratin, type II cytoskeletal 6B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6bQ9Z331 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt6bQ9Z331 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms