Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2W9

Gria3, Glutamate receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria3Q9Z2W9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gria3Q9Z2W9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gria3Q9Z2W9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gria3Q9Z2W9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gria3Q9Z2W9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gria3Q9Z2W9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gria3Q9Z2W9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gria3Q9Z2W9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gria3Q9Z2W9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gria3Q9Z2W9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gria3Q9Z2W9 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gria3Q9Z2W9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gria3Q9Z2W9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gria3Q9Z2W9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gria3Q9Z2W9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gria3Q9Z2W9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gria3Q9Z2W9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gria3Q9Z2W9 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms