Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms