Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms