Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms