Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Cldn7Q9Z261 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Cldn7Q9Z261 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Cldn7Q9Z261 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Cldn7Q9Z261 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Cldn7Q9Z261 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms