Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms