Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J3

Nfs1, Cysteine desulfurase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfs1Q9Z1J3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nfs1Q9Z1J3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms