Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1D9

Znf394, Zinc finger protein 394, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf394Q9Z1D9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf394Q9Z1D9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf394Q9Z1D9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf394Q9Z1D9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf394Q9Z1D9 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf394Q9Z1D9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf394Q9Z1D9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf394Q9Z1D9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Znf394Q9Z1D9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Znf394Q9Z1D9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf394Q9Z1D9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf394Q9Z1D9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Znf394Q9Z1D9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf394Q9Z1D9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Znf394Q9Z1D9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Znf394Q9Z1D9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Znf394Q9Z1D9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Znf394Q9Z1D9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf394Q9Z1D9 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf394Q9Z1D9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Znf394Q9Z1D9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
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Znf394Q9Z1D9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf394Q9Z1D9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf394Q9Z1D9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf394Q9Z1D9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Znf394Q9Z1D9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Znf394Q9Z1D9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf394Q9Z1D9 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf394Q9Z1D9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf394Q9Z1D9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf394Q9Z1D9 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf394Q9Z1D9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf394Q9Z1D9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Znf394Q9Z1D9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf394Q9Z1D9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf394Q9Z1D9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Znf394Q9Z1D9 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf394Q9Z1D9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf394Q9Z1D9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Znf394Q9Z1D9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf394Q9Z1D9 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf394Q9Z1D9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
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Znf394Q9Z1D9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf394Q9Z1D9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf394Q9Z1D9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf394Q9Z1D9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf394Q9Z1D9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf394Q9Z1D9 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf394Q9Z1D9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf394Q9Z1D9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf394Q9Z1D9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf394Q9Z1D9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf394Q9Z1D9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf394Q9Z1D9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Znf394Q9Z1D9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf394Q9Z1D9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf394Q9Z1D9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf394Q9Z1D9 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms