Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms