Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne6Q9Z140 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne6Q9Z140 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne6Q9Z140 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne6Q9Z140 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cpne6Q9Z140 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne6Q9Z140 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne6Q9Z140 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cpne6Q9Z140 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cpne6Q9Z140 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne6Q9Z140 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne6Q9Z140 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms