Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z132

Rspo1, R-spondin-1, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo1Q9Z132 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms