Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms