Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms