Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH2

Lhx9, LIM/homeobox protein Lhx9, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx9Q9WUH2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
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