Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUB0

Rbck1, RanBP-type and C3HC4-type zinc finger-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbck1Q9WUB0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbck1Q9WUB0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms