Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU78

Pdcd6ip, Programmed cell death 6-interacting protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd6ipQ9WU78 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcd6ipQ9WU78 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcd6ipQ9WU78 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcd6ipQ9WU78 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcd6ipQ9WU78 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcd6ipQ9WU78 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcd6ipQ9WU78 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcd6ipQ9WU78 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcd6ipQ9WU78 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcd6ipQ9WU78 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcd6ipQ9WU78 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcd6ipQ9WU78 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcd6ipQ9WU78 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcd6ipQ9WU78 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcd6ipQ9WU78 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcd6ipQ9WU78 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcd6ipQ9WU78 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcd6ipQ9WU78 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcd6ipQ9WU78 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcd6ipQ9WU78 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcd6ipQ9WU78 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcd6ipQ9WU78 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcd6ipQ9WU78 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcd6ipQ9WU78 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcd6ipQ9WU78 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcd6ipQ9WU78 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcd6ipQ9WU78 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdcd6ipQ9WU78 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdcd6ipQ9WU78 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdcd6ipQ9WU78 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdcd6ipQ9WU78 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdcd6ipQ9WU78 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdcd6ipQ9WU78 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdcd6ipQ9WU78 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdcd6ipQ9WU78 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdcd6ipQ9WU78 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdcd6ipQ9WU78 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdcd6ipQ9WU78 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdcd6ipQ9WU78 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdcd6ipQ9WU78 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdcd6ipQ9WU78 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdcd6ipQ9WU78 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdcd6ipQ9WU78 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pdcd6ipQ9WU78 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pdcd6ipQ9WU78 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pdcd6ipQ9WU78 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pdcd6ipQ9WU78 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcd6ipQ9WU78 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcd6ipQ9WU78 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcd6ipQ9WU78 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcd6ipQ9WU78 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcd6ipQ9WU78 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcd6ipQ9WU78 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcd6ipQ9WU78 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcd6ipQ9WU78 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcd6ipQ9WU78 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcd6ipQ9WU78 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcd6ipQ9WU78 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcd6ipQ9WU78 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcd6ipQ9WU78 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcd6ipQ9WU78 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcd6ipQ9WU78 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcd6ipQ9WU78 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcd6ipQ9WU78 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcd6ipQ9WU78 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcd6ipQ9WU78 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcd6ipQ9WU78 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcd6ipQ9WU78 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcd6ipQ9WU78 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcd6ipQ9WU78 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcd6ipQ9WU78 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcd6ipQ9WU78 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcd6ipQ9WU78 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcd6ipQ9WU78 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcd6ipQ9WU78 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcd6ipQ9WU78 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcd6ipQ9WU78 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcd6ipQ9WU78 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcd6ipQ9WU78 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcd6ipQ9WU78 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcd6ipQ9WU78 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcd6ipQ9WU78 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcd6ipQ9WU78 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pdcd6ipQ9WU78 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcd6ipQ9WU78 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcd6ipQ9WU78 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcd6ipQ9WU78 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pdcd6ipQ9WU78 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcd6ipQ9WU78 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcd6ipQ9WU78 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcd6ipQ9WU78 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcd6ipQ9WU78 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcd6ipQ9WU78 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcd6ipQ9WU78 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcd6ipQ9WU78 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcd6ipQ9WU78 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcd6ipQ9WU78 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcd6ipQ9WU78 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcd6ipQ9WU78 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcd6ipQ9WU78 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms