Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM4

Nfe2l3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, mousemouse

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Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2l3Q9WTM4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfe2l3Q9WTM4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms