Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Z8

Sorbs3, Vinexin, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs3Q9R1Z8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sorbs3Q9R1Z8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sorbs3Q9R1Z8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sorbs3Q9R1Z8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sorbs3Q9R1Z8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sorbs3Q9R1Z8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sorbs3Q9R1Z8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sorbs3Q9R1Z8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sorbs3Q9R1Z8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sorbs3Q9R1Z8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sorbs3Q9R1Z8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sorbs3Q9R1Z8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sorbs3Q9R1Z8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sorbs3Q9R1Z8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sorbs3Q9R1Z8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sorbs3Q9R1Z8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms