Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1S8

Capn7, Calpain-7, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn7Q9R1S8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn7Q9R1S8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms