Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L6

Pcm1, Pericentriolar material 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcm1Q9R0L6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms