Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms