Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms