Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms