Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms