Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ8

H2afy, Core histone macro-H2A.1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afyQ9QZQ8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms