Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms