Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms