Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tomm40Q9QYA2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms