Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VapbQ9QY76 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VapbQ9QY76 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VapbQ9QY76 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VapbQ9QY76 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VapbQ9QY76 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
VapbQ9QY76 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms