Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms