Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms