Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms