Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trp53inp1Q9QXE4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trp53inp1Q9QXE4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trp53inp1Q9QXE4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trp53inp1Q9QXE4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trp53inp1Q9QXE4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trp53inp1Q9QXE4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trp53inp1Q9QXE4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Trp53inp1Q9QXE4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trp53inp1Q9QXE4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms