Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms