Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms