Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS9

Reg3d, Reg III delta, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reg3dQ9QUS9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms