Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms