Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms