Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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