Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rabgef1Q9JM13 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rabgef1Q9JM13 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rabgef1Q9JM13 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rabgef1Q9JM13 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rabgef1Q9JM13 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rabgef1Q9JM13 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rabgef1Q9JM13 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rabgef1Q9JM13 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rabgef1Q9JM13 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rabgef1Q9JM13 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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Rabgef1Q9JM13 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rabgef1Q9JM13 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Rabgef1Q9JM13 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rabgef1Q9JM13 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rabgef1Q9JM13 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rabgef1Q9JM13 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Rabgef1Q9JM13 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rabgef1Q9JM13 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rabgef1Q9JM13 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rabgef1Q9JM13 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Rabgef1Q9JM13 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Rabgef1Q9JM13 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rabgef1Q9JM13 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Rabgef1Q9JM13 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Rabgef1Q9JM13 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Rabgef1Q9JM13 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rabgef1Q9JM13 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rabgef1Q9JM13 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Rabgef1Q9JM13 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rabgef1Q9JM13 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rabgef1Q9JM13 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rabgef1Q9JM13 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rabgef1Q9JM13 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rabgef1Q9JM13 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rabgef1Q9JM13 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rabgef1Q9JM13 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rabgef1Q9JM13 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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