Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Higd1aQ9JLR9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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