Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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Gde1Q9JL56 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Gde1Q9JL56 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Gde1Q9JL56 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Gde1Q9JL56 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms