Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

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Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Upk3aQ9JKX8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Upk3aQ9JKX8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Upk3aQ9JKX8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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