Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms